1348'de kurulan Charles Üniversitesi, dünyanın en eski üniversitelerinden biridir. Bununla birlikte modern, dinamik, kozmopolit ve prestijli bir yükseköğretim kurumu olarak bilinir. En büyük, en ünlü, uluslararası sıralamalarda en üst sıralarda yer alan Çek üniversitesidir.
Üniversite Çek Cumhuriyeti'nde en iyi performans gösteren araştırma kurumudur. Araştırma faaliyetleri (mevcut ulusal araştırma değerlendirme yöntemlerine göre) neredeyse yarım milyon puan toplayan Charles Üniversitesi, ikinci sırada yer alan kurumun çok ilerisindedir.
2016-2017 için Times Higher Education Dünya Üniversite Sıralamasında ilk beş yüz üniversite arasında 305'inci sırada yer alan Charles Üniversitesi, ilk beş yüz listesinde yer alan tek Çek üniversitesi olmuştur.
Şangay Ligine” göre dünyanın en iyi üniversiteleri arasında %2’lik dilimdedir ve Avrupa'nın en iyi 100 üniversitesinden biridir.
Üniversitenin YÖK denkliği bulunmaktadır.
